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Showing content from http://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/ToolBox/CPP_DOC/doxyhtml/sm__pam70_8c_source.html below:

NCBI C++ ToolKit: src/util/tables/sm_pam70.c Source File

41

5, -4, -2, -1, -4, -2, -1, 0, -4, -2, -4, -4, -3,

42

-6, 0, 1, 1, -9, -5, -1, -1, -3, -1, -1,-11,

43

-4, 8, -3, -6, -5, 0, -5, -6, 0, -3, -6, 2, -2,

44

-7, -2, -1, -4, 0, -7, -5, -4, -5, -2, -1,-11,

45

-2, -3, 6, 3, -7, -1, 0, -1, 1, -3, -5, 0, -5,

46

-6, -3, 1, 0, -6, -3, -5, 5, -4, -1, -1,-11,

47

-1, -6, 3, 6, -9, 0, 3, -1, -1, -5, -8, -2, -7,

48

-10, -4, -1, -2,-10, -7, -5, 5, -7, 2, -1,-11,

49

-4, -5, -7, -9, 9, -9, -9, -6, -5, -4,-10, -9, -9,

50

-8, -5, -1, -5,-11, -2, -4, -8, -7, -9, -1,-11,

51

-2, 0, -1, 0, -9, 7, 2, -4, 2, -5, -3, -1, -2,

52

-9, -1, -3, -3, -8, -8, -4, -1, -3, 5, -1,-11,

53

-1, -5, 0, 3, -9, 2, 6, -2, -2, -4, -6, -2, -4,

54

-9, -3, -2, -3,-11, -6, -4, 2, -5, 5, -1,-11,

55

0, -6, -1, -1, -6, -4, -2, 6, -6, -6, -7, -5, -6,

56

-7, -3, 0, -3,-10, -9, -3, -1, -7, -3, -1,-11,

57

-4, 0, 1, -1, -5, 2, -2, -6, 8, -6, -4, -3, -6,

58

-4, -2, -3, -4, -5, -1, -4, 0, -4, 1, -1,-11,

59

-2, -3, -3, -5, -4, -5, -4, -6, -6, 7, 1, -4, 1,

60

0, -5, -4, -1, -9, -4, 3, -4, 4, -4, -1,-11,

61

-4, -6, -5, -8,-10, -3, -6, -7, -4, 1, 6, -5, 2,

62

-1, -5, -6, -4, -4, -4, 0, -6, 5, -4, -1,-11,

63

-4, 2, 0, -2, -9, -1, -2, -5, -3, -4, -5, 6, 0,

64

-9, -4, -2, -1, -7, -7, -6, -1, -5, -2, -1,-11,

65

-3, -2, -5, -7, -9, -2, -4, -6, -6, 1, 2, 0, 10,

66

-2, -5, -3, -2, -8, -7, 0, -6, 2, -3, -1,-11,

67

-6, -7, -6,-10, -8, -9, -9, -7, -4, 0, -1, -9, -2,

68

8, -7, -4, -6, -2, 4, -5, -7, -1, -9, -1,-11,

69

0, -2, -3, -4, -5, -1, -3, -3, -2, -5, -5, -4, -5,

70

-7, 7, 0, -2, -9, -9, -3, -4, -5, -2, -1,-11,

71

1, -1, 1, -1, -1, -3, -2, 0, -3, -4, -6, -2, -3,

72

-4, 0, 5, 2, -3, -5, -3, 0, -5, -2, -1,-11,

73

1, -4, 0, -2, -5, -3, -3, -3, -4, -1, -4, -1, -2,

74

-6, -2, 2, 6, -8, -4, -1, -1, -3, -3, -1,-11,

75

-9, 0, -6,-10,-11, -8,-11,-10, -5, -9, -4, -7, -8,

76

-2, -9, -3, -8, 13, -3,-10, -7, -5,-10, -1,-11,

77

-5, -7, -3, -7, -2, -8, -6, -9, -1, -4, -4, -7, -7,

78

4, -9, -5, -4, -3, 9, -5, -4, -4, -7, -1,-11,

79

-1, -5, -5, -5, -4, -4, -4, -3, -4, 3, 0, -6, 0,

80

-5, -3, -3, -1,-10, -5, 6, -5, 1, -4, -1,-11,

81

-1, -4, 5, 5, -8, -1, 2, -1, 0, -4, -6, -1, -6,

82

-7, -4, 0, -1, -7, -4, -5, 5, -5, 1, -1,-11,

83

-3, -5, -4, -7, -7, -3, -5, -7, -4, 4, 5, -5, 2,

84

-1, -5, -5, -3, -5, -4, 1, -5, 5, -4, -1,-11,

85

-1, -2, -1, 2, -9, 5, 5, -3, 1, -4, -4, -2, -3,

86

-9, -2, -2, -3,-10, -7, -4, 1, -4, 5, -1,-11,

87

-1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1,

88

-1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1,-11,

89

-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,

90

-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11,-11, 1

93 "ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBJZX*"

int TNCBIScore

data types

static const TNCBIScore s_Pam70PSM[25 *25]

Entries for the PAM70 matrix at a scale of ln(2)/2.0.

const SNCBIPackedScoreMatrix NCBISM_Pam70

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