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NCBI C++ ToolKit: src/util/tables/sm_blosum90.c Source File

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5, -2, -2, -3, -1, -1, -1, 0, -2, -2, -2, -1, -2,

42

-3, -1, 1, 0, -4, -3, -1, -2, -2, -1, -1, -6,

43

-2, 6, -1, -3, -5, 1, -1, -3, 0, -4, -3, 2, -2,

44

-4, -3, -1, -2, -4, -3, -3, -2, -3, 0, -1, -6,

45

-2, -1, 7, 1, -4, 0, -1, -1, 0, -4, -4, 0, -3,

46

-4, -3, 0, 0, -5, -3, -4, 5, -4, -1, -1, -6,

47

-3, -3, 1, 7, -5, -1, 1, -2, -2, -5, -5, -1, -4,

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-5, -3, -1, -2, -6, -4, -5, 5, -5, 1, -1, -6,

49

-1, -5, -4, -5, 9, -4, -6, -4, -5, -2, -2, -4, -2,

50

-3, -4, -2, -2, -4, -4, -2, -4, -2, -5, -1, -6,

51

-1, 1, 0, -1, -4, 7, 2, -3, 1, -4, -3, 1, 0,

52

-4, -2, -1, -1, -3, -3, -3, -1, -3, 5, -1, -6,

53

-1, -1, -1, 1, -6, 2, 6, -3, -1, -4, -4, 0, -3,

54

-5, -2, -1, -1, -5, -4, -3, 1, -4, 5, -1, -6,

55

0, -3, -1, -2, -4, -3, -3, 6, -3, -5, -5, -2, -4,

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-5, -3, -1, -3, -4, -5, -5, -2, -5, -3, -1, -6,

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-2, 0, 0, -2, -5, 1, -1, -3, 8, -4, -4, -1, -3,

58

-2, -3, -2, -2, -3, 1, -4, -1, -4, 0, -1, -6,

59

-2, -4, -4, -5, -2, -4, -4, -5, -4, 5, 1, -4, 1,

60

-1, -4, -3, -1, -4, -2, 3, -5, 3, -4, -1, -6,

61

-2, -3, -4, -5, -2, -3, -4, -5, -4, 1, 5, -3, 2,

62

0, -4, -3, -2, -3, -2, 0, -5, 4, -4, -1, -6,

63

-1, 2, 0, -1, -4, 1, 0, -2, -1, -4, -3, 6, -2,

64

-4, -2, -1, -1, -5, -3, -3, -1, -3, 1, -1, -6,

65

-2, -2, -3, -4, -2, 0, -3, -4, -3, 1, 2, -2, 7,

66

-1, -3, -2, -1, -2, -2, 0, -4, 2, -2, -1, -6,

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69

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70

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71

1, -1, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -2, -3, -3, -1, -2,

72

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0, -2, 0, -2, -2, -1, -1, -3, -2, -1, -2, -1, -1,

74

-3, -2, 1, 6, -4, -2, -1, -1, -2, -1, -1, -6,

75

-4, -4, -5, -6, -4, -3, -5, -4, -3, -4, -3, -5, -2,

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0, -5, -4, -4, 11, 2, -3, -6, -3, -4, -1, -6,

77

-3, -3, -3, -4, -4, -3, -4, -5, 1, -2, -2, -3, -2,

78

3, -4, -3, -2, 2, 8, -3, -4, -2, -3, -1, -6,

79

-1, -3, -4, -5, -2, -3, -3, -5, -4, 3, 0, -3, 0,

80

-2, -3, -2, -1, -3, -3, 5, -4, 1, -3, -1, -6,

81

-2, -2, 5, 5, -4, -1, 1, -2, -1, -5, -5, -1, -4,

82

-4, -3, 0, -1, -6, -4, -4, 5, -5, 0, -1, -6,

83

-2, -3, -4, -5, -2, -3, -4, -5, -4, 3, 4, -3, 2,

84

0, -4, -3, -2, -3, -2, 1, -5, 4, -4, -1, -6,

85

-1, 0, -1, 1, -5, 5, 5, -3, 0, -4, -4, 1, -2,

86

-4, -2, -1, -1, -4, -3, -3, 0, -4, 5, -1, -6,

87

-1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1,

88

-1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -6,

89

-6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6,

90

-6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, 1

93 "ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBJZX*"

int TNCBIScore

data types

static const TNCBIScore s_Blosum90PSM[25 *25]

Entries for the BLOSUM90 matrix at a scale of ln(2)/2.0.

const SNCBIPackedScoreMatrix NCBISM_Blosum90

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