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NCBI C++ ToolKit: src/util/tables/sm_blosum50.c Source File

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5, -2, -1, -2, -1, -1, -1, 0, -2, -1, -2, -1, -1,

42

-3, -1, 1, 0, -3, -2, 0, -2, -2, -1, -1, -5,

43

-2, 7, -1, -2, -4, 1, 0, -3, 0, -4, -3, 3, -2,

44

-3, -3, -1, -1, -3, -1, -3, -1, -3, 0, -1, -5,

45

-1, -1, 7, 2, -2, 0, 0, 0, 1, -3, -4, 0, -2,

46

-4, -2, 1, 0, -4, -2, -3, 5, -4, 0, -1, -5,

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-2, -2, 2, 8, -4, 0, 2, -1, -1, -4, -4, -1, -4,

48

-5, -1, 0, -1, -5, -3, -4, 6, -4, 1, -1, -5,

49

-1, -4, -2, -4, 13, -3, -3, -3, -3, -2, -2, -3, -2,

50

-2, -4, -1, -1, -5, -3, -1, -3, -2, -3, -1, -5,

51

-1, 1, 0, 0, -3, 7, 2, -2, 1, -3, -2, 2, 0,

52

-4, -1, 0, -1, -1, -1, -3, 0, -3, 4, -1, -5,

53

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55

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58

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-1, -4, -3, -4, -2, -3, -4, -4, -4, 5, 2, -3, 2,

60

0, -3, -3, -1, -3, -1, 4, -4, 4, -3, -1, -5,

61

-2, -3, -4, -4, -2, -2, -3, -4, -3, 2, 5, -3, 3,

62

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63

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65

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66

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71

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74

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75

-3, -3, -4, -5, -5, -1, -3, -3, -3, -3, -2, -3, -1,

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1, -4, -4, -3, 15, 2, -3, -5, -2, -2, -1, -5,

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-2, -1, -2, -3, -3, -1, -2, -3, 2, -1, -1, -2, 0,

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80

-1, -3, -2, 0, -3, -1, 5, -3, 2, -3, -1, -5,

81

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82

-4, -2, 0, 0, -5, -3, -3, 6, -4, 1, -1, -5,

83

-2, -3, -4, -4, -2, -3, -3, -4, -3, 4, 4, -3, 2,

84

1, -3, -3, -1, -2, -1, 2, -4, 4, -3, -1, -5,

85

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-4, -1, 0, -1, -2, -2, -3, 1, -3, 5, -1, -5,

87

-1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1,

88

-1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -5,

89

-5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5,

90

-5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1

93 "ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBJZX*"

int TNCBIScore

data types

const SNCBIPackedScoreMatrix NCBISM_Blosum50

static const TNCBIScore s_Blosum50PSM[25 *25]

Entries for the BLOSUM50 matrix at a scale of ln(2)/3.0.

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