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NCBI C++ ToolKit: src/util/tables/sm_blosum45.c Source File

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5, -2, -1, -2, -1, -1, -1, 0, -2, -1, -1, -1, -1,

42

-2, -1, 1, 0, -2, -2, 0, -1, -1, -1, -1, -5,

43

-2, 7, 0, -1, -3, 1, 0, -2, 0, -3, -2, 3, -1,

44

-2, -2, -1, -1, -2, -1, -2, -1, -3, 1, -1, -5,

45

-1, 0, 6, 2, -2, 0, 0, 0, 1, -2, -3, 0, -2,

46

-2, -2, 1, 0, -4, -2, -3, 5, -3, 0, -1, -5,

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-2, -1, 2, 7, -3, 0, 2, -1, 0, -4, -3, 0, -3,

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-4, -1, 0, -1, -4, -2, -3, 6, -3, 1, -1, -5,

49

-1, -3, -2, -3, 12, -3, -3, -3, -3, -3, -2, -3, -2,

50

-2, -4, -1, -1, -5, -3, -1, -2, -2, -3, -1, -5,

51

-1, 1, 0, 0, -3, 6, 2, -2, 1, -2, -2, 1, 0,

52

-4, -1, 0, -1, -2, -1, -3, 0, -2, 4, -1, -5,

53

-1, 0, 0, 2, -3, 2, 6, -2, 0, -3, -2, 1, -2,

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-3, 0, 0, -1, -3, -2, -3, 1, -3, 5, -1, -5,

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0, -2, 0, -1, -3, -2, -2, 7, -2, -4, -3, -2, -2,

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-3, -2, 0, -2, -2, -3, -3, -1, -4, -2, -1, -5,

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-2, 0, 1, 0, -3, 1, 0, -2, 10, -3, -2, -1, 0,

58

-2, -2, -1, -2, -3, 2, -3, 0, -2, 0, -1, -5,

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-1, -3, -2, -4, -3, -2, -3, -4, -3, 5, 2, -3, 2,

60

0, -2, -2, -1, -2, 0, 3, -3, 4, -3, -1, -5,

61

-1, -2, -3, -3, -2, -2, -2, -3, -2, 2, 5, -3, 2,

62

1, -3, -3, -1, -2, 0, 1, -3, 4, -2, -1, -5,

63

-1, 3, 0, 0, -3, 1, 1, -2, -1, -3, -3, 5, -1,

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-3, -1, -1, -1, -2, -1, -2, 0, -3, 1, -1, -5,

65

-1, -1, -2, -3, -2, 0, -2, -2, 0, 2, 2, -1, 6,

66

0, -2, -2, -1, -2, 0, 1, -2, 2, -1, -1, -5,

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-2, -2, -2, -4, -2, -4, -3, -3, -2, 0, 1, -3, 0,

68

8, -3, -2, -1, 1, 3, 0, -3, 1, -3, -1, -5,

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-1, -2, -2, -1, -4, -1, 0, -2, -2, -2, -3, -1, -2,

70

-3, 9, -1, -1, -3, -3, -3, -2, -3, -1, -1, -5,

71

1, -1, 1, 0, -1, 0, 0, 0, -1, -2, -3, -1, -2,

72

-2, -1, 4, 2, -4, -2, -1, 0, -2, 0, -1, -5,

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0, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, -1, -1, -1,

74

-1, -1, 2, 5, -3, -1, 0, 0, -1, -1, -1, -5,

75

-2, -2, -4, -4, -5, -2, -3, -2, -3, -2, -2, -2, -2,

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1, -3, -4, -3, 15, 3, -3, -4, -2, -2, -1, -5,

77

-2, -1, -2, -2, -3, -1, -2, -3, 2, 0, 0, -1, 0,

78

3, -3, -2, -1, 3, 8, -1, -2, 0, -2, -1, -5,

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0, -2, -3, -3, -1, -3, -3, -3, -3, 3, 1, -2, 1,

80

0, -3, -1, 0, -3, -1, 5, -3, 2, -3, -1, -5,

81

-1, -1, 5, 6, -2, 0, 1, -1, 0, -3, -3, 0, -2,

82

-3, -2, 0, 0, -4, -2, -3, 5, -3, 1, -1, -5,

83

-1, -3, -3, -3, -2, -2, -3, -4, -2, 4, 4, -3, 2,

84

1, -3, -2, -1, -2, 0, 2, -3, 4, -2, -1, -5,

85

-1, 1, 0, 1, -3, 4, 5, -2, 0, -3, -2, 1, -1,

86

-3, -1, 0, -1, -2, -2, -3, 1, -2, 5, -1, -5,

87

-1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1,

88

-1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -5,

89

-5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5,

90

-5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1

93 "ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBJZX*"

int TNCBIScore

data types

static const TNCBIScore s_Blosum45PSM[25 *25]

Entries for the BLOSUM45 matrix at a scale of ln(2)/3.0.

const SNCBIPackedScoreMatrix NCBISM_Blosum45

The standard matrices.

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