Go to the source code of this file.
Go to the SVN repository for this file.
◆ NCBI_TEST_APPLICATION ◆ TSeqLocs ◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [1/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestBond )Definition at line 544 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References CSeq_loc_I::eMake_PreserveType, eNa_strand_minus, eNa_strand_plus, CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::GetRange(), CSeq_loc_CI::GetRangeAsSeq_loc(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_CI::GetStrand(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_CI::IsBondA(), CSeq_loc_CI::IsBondB(), CSeq_loc_CI::IsEmpty(), CSeq_id_Base::IsGi(), CSeq_loc_CI::IsInBond(), CSeq_loc_CI::IsInEquivSet(), CSeq_loc_CI::IsPoint(), CSeq_loc_CI::IsSetStrand(), CSeq_loc_CI::IsWhole(), MakeASN(), MakeLoc(), and CSeq_loc_I::MakeSeq_loc().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [2/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestDouble )Definition at line 103 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References eNa_strand_minus, eNa_strand_plus, CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::GetRange(), CSeq_loc_CI::GetRangeAsSeq_loc(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_CI::GetStrand(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_CI::IsEmpty(), CSeq_id_Base::IsGi(), CSeq_loc_CI::IsInBond(), CSeq_loc_CI::IsInEquivSet(), CSeq_loc_CI::IsPoint(), CSeq_loc_CI::IsSetStrand(), CSeq_loc_CI::IsWhole(), MakeASN(), and MakeLoc().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [3/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestEdit1 )Definition at line 293 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References eNa_strand_minus, eNa_strand_plus, CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::GetRange(), CSeq_loc_CI::GetRangeAsSeq_loc(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_CI::GetStrand(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_CI::IsEmpty(), CSeq_id_Base::IsGi(), CSeq_loc_CI::IsInBond(), CSeq_loc_CI::IsInEquivSet(), CSeq_loc_CI::IsPoint(), CSeq_loc_CI::IsSetStrand(), CSeq_loc_CI::IsWhole(), MakeASN(), MakeLoc(), CSeq_loc_I::MakeSeq_loc(), CSeq_loc_I::SetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_I::SetStrand(), and CSeq_loc_I::SetTo().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [4/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestEdit2 )Definition at line 374 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References eNa_strand_minus, eNa_strand_plus, CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::GetRange(), CSeq_loc_CI::GetRangeAsSeq_loc(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_CI::GetStrand(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_CI::IsEmpty(), CSeq_id_Base::IsGi(), CSeq_loc_CI::IsInBond(), CSeq_loc_CI::IsInEquivSet(), CSeq_loc_CI::IsPoint(), CSeq_loc_CI::IsSetStrand(), CSeq_loc_CI::IsWhole(), MakeASN(), MakeLoc(), CSeq_loc_I::MakeSeq_loc(), CSeq_loc_I::SetPoint(), and CSeq_loc_I::SetSeq_id_Handle().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [5/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestEdit3 )Definition at line 459 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References CSeq_loc_I::eMake_PreserveType, eNa_strand_minus, eNa_strand_plus, CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::GetRange(), CSeq_loc_CI::GetRangeAsSeq_loc(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_CI::GetStrand(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_CI::IsEmpty(), CSeq_id_Base::IsGi(), CSeq_loc_CI::IsInBond(), CSeq_loc_CI::IsInEquivSet(), CSeq_loc_CI::IsPoint(), CSeq_loc_CI::IsSetStrand(), CSeq_loc_CI::IsWhole(), MakeASN(), MakeLoc(), CSeq_loc_I::MakeSeq_loc(), CSeq_loc_I::SetSeq_id_Handle(), and CSeq_loc_I::SetTo().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [6/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestEquiv )Definition at line 157 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References eNa_strand_minus, eNa_strand_plus, CSeq_loc_CI::GetEquivPartRange(), CSeq_loc_CI::GetEquivSetRange(), CSeq_loc_CI::GetEquivSetsCount(), CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::GetRange(), CSeq_loc_CI::GetRangeAsSeq_loc(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_CI::GetStrand(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_CI::IsEmpty(), CSeq_id_Base::IsGi(), CSeq_loc_CI::IsInBond(), CSeq_loc_CI::IsInEquivSet(), CSeq_loc_CI::IsPoint(), CSeq_loc_CI::IsSetStrand(), CSeq_loc_CI::IsWhole(), MakeASN(), and MakeLoc().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [7/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestMakeBond )Definition at line 614 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References CSeq_loc_I::eMake_PreserveType, eNa_strand_minus, eNa_strand_plus, CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::GetRange(), CSeq_loc_CI::GetRangeAsSeq_loc(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_CI::GetStrand(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_CI::IsEmpty(), CSeq_id_Base::IsGi(), CSeq_loc_CI::IsInBond(), CSeq_loc_CI::IsInEquivSet(), CSeq_loc_CI::IsPoint(), CSeq_loc_CI::IsSetStrand(), CSeq_loc_CI::IsWhole(), MakeASN(), CSeq_loc_I::MakeBondAB(), MakeLoc(), CSeq_loc_I::MakeSeq_loc(), CSeq_loc_I::RemoveBond(), and CSeq_loc_CI::SetPos().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [8/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestMakeEquiv1 )Definition at line 843 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References CSeq_loc_I::eMake_CompactType, CSeq_loc_I::eMake_PreserveType, eNa_strand_minus, eNa_strand_plus, CSeq_loc_I::GetEquivPartRange(), CSeq_loc_I::GetEquivSetRange(), CSeq_loc_CI::GetEquivSetsCount(), CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::GetRange(), CSeq_loc_CI::GetRangeAsSeq_loc(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_CI::GetStrand(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_CI::IsEmpty(), CSeq_id_Base::IsGi(), CSeq_loc_CI::IsInBond(), CSeq_loc_CI::IsInEquivSet(), CSeq_loc_CI::IsPoint(), CSeq_loc_CI::IsSetStrand(), CSeq_loc_CI::IsWhole(), MakeASN(), MakeLoc(), and CSeq_loc_I::MakeSeq_loc().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [9/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestMakeEquiv2 )Definition at line 1054 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References CSeq_loc_I::eMake_PreserveType, eNa_strand_minus, eNa_strand_plus, CSeq_loc_I::GetEquivPartRange(), CSeq_loc_I::GetEquivSetRange(), CSeq_loc_CI::GetEquivSetsCount(), CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::GetRange(), CSeq_loc_CI::GetRangeAsSeq_loc(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_CI::GetStrand(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_CI::IsEmpty(), CSeq_id_Base::IsGi(), CSeq_loc_CI::IsInBond(), CSeq_loc_CI::IsInEquivSet(), CSeq_loc_CI::IsPoint(), CSeq_loc_CI::IsSetStrand(), CSeq_loc_CI::IsWhole(), MakeASN(), MakeLoc(), and CSeq_loc_I::MakeSeq_loc().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [10/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestMakeEquiv3 ) ◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [11/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestMakeEquiv4 ) ◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [12/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestMakeEquiv5 ) ◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [13/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestMakeEquiv6 ) ◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [14/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestMakeEquiv7 )Definition at line 1270 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References CSeq_loc_I::eEquiv_new_equiv, CSeq_loc_I::eEquiv_new_part, CSeq_loc_I::eEquiv_none, CSeq_loc_I::eMake_PreserveType, eNa_strand_minus, eNa_strand_plus, CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_I::InsertInterval(), MakeASN(), MakeLoc(), CSeq_loc_I::MakeSeq_loc(), and CSeq_loc_I::SetEquivMode().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [15/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestSingle )Definition at line 73 of file seq_loc_unit_test.cpp.
References CSeq_id_Handle::GetGiHandle(), CSeq_loc_CI::GetRange(), CSeq_loc_CI::GetRangeAsSeq_loc(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id(), CSeq_loc_CI::GetSeq_id_Handle(), CSeq_loc_CI::HasEquivSets(), CSeq_loc_CI::IsEmpty(), CSeq_id_Base::IsGi(), CSeq_loc_CI::IsInBond(), CSeq_loc_CI::IsInEquivSet(), CSeq_loc_CI::IsPoint(), CSeq_loc_CI::IsSetStrand(), CSeq_loc_CI::IsWhole(), MakeASN(), and MakeLoc().
◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [16/16] BOOST_AUTO_TEST_CASE ( TestTotalRange ) ◆ DEFINE_STATIC_MUTEX() DEFINE_STATIC_MUTEX ( s_BoostMutex ) ◆ MakeASN() ◆ MakeLoc() ◆ USING_SCOPE() ◆ USING_NCBI_SCOPERetroSearch is an open source project built by @garambo | Open a GitHub Issue
Search and Browse the WWW like it's 1997 | Search results from DuckDuckGo
HTML:
3.2
| Encoding:
UTF-8
| Version:
0.7.4